Отправить статью по E-mail 
Создание линии индуцированных плюрипотентных стволовых клеток RCPCMi009-A-1 с нокаутом гена UBE2A с помощью технологии редактирования генома CRISPR/Cas9
- Авторы: Хомякова Е.А.1, Федоренко А.В.1,2, Сурдина А.В.1, Воловиков Е.А.1,3, Беликова Л.Д.1,3, Зеркаленкова Е.А.4, Лагарькова М.А.1,5, Богомазова А.Н.1,3,5
-
Учреждения:
- Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина
- Сколковский институт науки и технологий
- Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
- Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Рогачева
- Центр высокоточного редактирования генома и генетических технологий в биомедицине, Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина
- Выпуск: Том 54, № 6 (2023)
- Страницы: 405-414
- Раздел: КОЛЛЕКЦИЯ ЛИНИЙ ПЛЮРИПОТЕНТНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК
- URL: https://ruspoj.com/0475-1450/article/view/669914
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0475145023060046
- EDN: https://elibrary.ru/HKXTMY
- ID: 669914
Цитировать
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Только для подписчиков
Аннотация
Делеции и мутации в гене UBE2A вызывают Х-сцепленный синдром умственной отсталости типа Насименто, впервые описанный в 2006 г. (Nascimento et al., 2006). На настоящий момент известно около двух десятков миссенс- и нонсенс-мутаций в гене UBE2A, ассоциированных с синдромом умственной отсталости по типу Насименто (Cordeddu et al., 2020). Для изучения роли гена UBE2A в развитии центральной нервной системы мы создали линию индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК) человека с нокаутом гена UBE2A (RCPCMi009-A-1) с использованием технологии редактирования генома CRISPR/Cas9. Нокаут гена UBE2A был подтвержден Вестерн-блоттингом. Плюрипотентность линии ИПСК RCPCMi009-A-1 была подтверждена типичной морфологией плюрипотентных стволовых клеток, нормальным кариотипом (46,XY), экспрессией маркеров плюрипотентности и способностью дифференцироваться в производные трех зародышевых листков.
Об авторах
Е. А. Хомякова
Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центрфизико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина
Автор, ответственный за переписку.
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а
А. В. Федоренко
Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центрфизико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина; Сколковский институт науки и технологий
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а; Россия, 121205, Москва, Большой бул., 30, стр. 1
А. В. Сурдина
Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центрфизико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а
Е. А. Воловиков
Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центрфизико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина; Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а; Россия, 634050, Томск, пер. Кооперативный, 5
Л. Д. Беликова
Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центрфизико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина; Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а; Россия, 634050, Томск, пер. Кооперативный, 5
Е. А. Зеркаленкова
Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Рогачева
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 117997, Москва, ул. Саморы Машела, 1
М. А. Лагарькова
Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центрфизико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина; Центр высокоточного редактирования генома и генетических технологий в биомедицине,
Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а; Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а
А. Н. Богомазова
Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центрфизико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина; Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук; Центр высокоточного редактирования генома и генетических технологий в биомедицине,
Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина
Email: kate.hom@gmail.com
Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а; Россия, 634050, Томск, пер. Кооперативный, 5; Россия, 119435, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а
Список литературы
- Bogomazova A.N., Lagarkova M.A., Tskhovrebova L.V. et al. Error-prone nonhomologous end joining repair operates in human pluripotent stem cells during late G2 // Aging (Albany NY). 2011. V. 3. № 6. P. 584.
- Concordet J.P., Haeussler M. CRISPOR: intuitive guide selection for CRISPR/Cas9 genome editing experiments and screens // Nucleic Acids Research. 2018. V. 46. № W1. P. W242–W245.
- Czepulkowski B., Bhatt B., Rooney D. Malignancy and acquired abnormalities. Vol. 2. Oxford University Press. New York. 1992. V. 2. P. 1–25.
- Dover J., Schneider J., Tawiah-Boateng M.A. et al. Methylation of histone H3 by COMPASS requires ubiquitination of histone H2B by Rad6 // J. Biological Chemistry. 2002. V. 277. № 32. P. 28368–28371.
- Hibbert R.G., Huang A., Boelens R. et al. E3 ligase Rad18 promotes monoubiquitination rather than ubiquitin chain formation by E2 enzyme Rad6 // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2011. V. 108. № 14. P. 5590–5595.
- Holmqvist S., Lehtonen Š., Chumarina M. et al. Creation of a library of induced pluripotent stem cells from Parkinsonian patients // npj Parkinson’s Disease. 2016. V. 2. № 1. P. 1–10.
- Nascimento R.M., Otto P.A., de Brouwer A.P. et al. UBE2A, which encodes a ubiquitin-conjugating enzyme, is mutated in a novel X-linked mental retardation syndrome // The American J. Human Genetics. 2006. V. 79. № 3. P. 549–555.
- Pliatsika V., Rigoutsos I. “Off-Spotter”: very fast and exhaustive enumeration of genomic lookalikes for designing CRISPR/Cas guide RNAs // Biology Direct. 2015. V. 10. P. 1–10.
- Van Kuppeveld F.J., Van der Logt J.T., Angulo A.F. et al. Genus-and species-specific identification of mycoplasmas by 16S rRNA amplification // Applied and Environmental Microbiology. 1992. V. 58. № 8. P. 2606–2615.
- Wojcik F., Dann G.P., Beh L.Y. et al. Functional crosstalk between histone H2B ubiquitylation and H2A modifications and variants // Nature Communications. 2018. V. 9. № 1. P 1–11.
Дополнительные файлы
