Филогения и характеристика эндофитных бактерий из растений гороха (Pisum sativum L.), выделенных из ризосферы проростков

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Ранее было показано, что эндофитные бактерии могут перемещаться из корней проростков растений гороха (Pisum sativum L.) в ризосферу. В настоящей работе при выращивании проростков на водной среде из среды для роста корней выделены 6 штаммов бактерий. С помощью анализа нуклеотидной последовательности фрагментов генов 16S рРНК установлено таксономическое положение этих штаммов с точностью до рода. Изучены культурально-морфологические признаки, активность гидролитических ферментов (пектиназы, целлюлазы, протеазы), ИУК-продуцирующая способность. Обнаружено, что количество эндофитных бактерий, оказывающихся на поверхности корня проростков гороха, существенно превышает их количество в тканях корня. Сделано предположение, что в перемещении исследуемых бактерий во внешнюю среду принимали участие гидролитические ферменты пектиназы и целлюлазы, вызывающие разрушение углеводных структур растительных клеточных стенок. Обсуждаются особенности метаболизма у исследуемых штаммов эндофитных бактерий и их значение для растения-хозяина после их выхода из корней в ризосферу.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Л. Е. Макарова

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Иркутск, 664033

Ю. А. Маркова

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Иркутск, 664033

Ю. В. Зайцева

Ярославский государственный университет им. П.Г. Демидова

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Ярославль, 150003

А. А. Бычкова

Ярославский государственный университет им. П.Г. Демидова

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Ярославль, 150003

И. В. Горбенко

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Иркутск, 664033

Ю. М. Константинов

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук; Иркутский государственный университет

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Иркутск, 664033

И. А. Васильев

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Иркутск, 664033

А. С. Мориц

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Иркутск, 664033

П. А. Бизиков

Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

Email: makarova@sifibr.irk.ru
Россия, Иркутск, 664033

Список литературы

  1. Muresu R., Polone E., Sulas L., Baldan B., Tondello A., Delogu G., Cappuccinelli P. et al. // FEMS Microbiol Ecol. 2008. V. 63. P. 383–400.
  2. Гарипова С.Р. // Успехи современной биологии. 2012. Т. 132. № 11. С. 493–505.
  3. Чеботарь В.К., Мальфанова Н.В., Щербаков А.В., Ахтемова Г.А., Борисов А.Ю., Люгтенберг Б., Тихонович И.А. // Прикл. биохимия и микробиология. 2015. Т. 51. № 3. С. 283–289. https://doi.org/10.7868/S0555109915030058
  4. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Тихонович И.А. // Экологическая генетика. 2019. Т. 17. № 1. С. 19–32. https://doi.org/10.17816/ecogen17119-32
  5. Гарипова С.Р., Гарифуллина Д.В., Баймиев А.Х., Хайруллин Р.М. // Прикл. биохимия и микробиология. 2017. Т. 53. № 3. С. 299–307.
  6. Martinez-Hidalgo P., Hirsh A.M. // Phytobioms. 2017. V. 1. № 2. P. 70–82.
  7. Benito P., Alonso-Vega P., Aguado C., Luján R., Anzai Y., Hirsch A.M., Trujillo M.E. // Sc. Rep. 2017. V. 7. Art. 11051. https://doi.org/10.1038/s41598-017-11428-1
  8. Dudeja S.S., Giri R., Saini R., Suneja-Madan P., Kothe E. // J. Basic Microbiol. 2012. V. 52. № 3. P. 248–260.
  9. Макарова Л.Е., Маркова Ю.А., Мориц А.С., Карепова М.С., Сидоров А.В., Соколова Н.А. // Прикл. биохимия и микробиология. 2021. Т. 57. № 4. С. 394–401. https://doi.org/10.31857/S0555109921040103
  10. Макарова Л.Е., Смирнов В.И., Клыба Л.В., Петрова И.Г., Дударева Л.В. // Прикл. биохимия и микробиология. 2012. Т. 48. № 4. С. 394–402
  11. Шафикова Т.Н., Омеличкина Ю.В., Еникеев А.Г., Бояркина С.В., Гвильдис Д.Э., Семенов А.А. // Докл. Академии наук. 2018. Т. 480. № 3. С. 381–383. https://doi.org/10.7868/S0869565218150264
  12. Quast C., Pruesse E., Yilmaz P., Gerken J., Schweer T., Yarza P. et al. // Nucl. Acids. Res. 2013. V. 41 (D1). P. D590–D596. https://doi.org/10.1093/nar/gks1219
  13. Callahan B.J., McMurdie P.J., Rosen M.J., Han A.W., Johnson A.J., Holmes S.P. // Nat. Methods. 2016. V. 13. № 7. P. 581–583. https://doi.org/10.1038/nmeth.3869
  14. Katoh K., Standley D.M. // Mol. Biol. Evol. 2013. V. 30. № 4. P. 772–780. https://doi.org/10.1093/molbev/mst010
  15. Tamura K., Stecher G., Kumar S. MEGA11: // Mol. Biol. Evol. 2021. V. 38. P. 3022–3027. https://doi.org/10.1093/molbev/msab120
  16. Saitou N., Nei M. // Mol. Biol. Evol. 1987. V. 4. P. 406–425. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040454
  17. Nei M., Kumar S. Molecular Evolution and Phylogenetics. New York: Oxford University Press, 2000. 350 p.
  18. Желдакова Р.А., Мямин В.Е. Фитопатогенные микроорганизмы. Минск: БГУ, 2005. 116 с.
  19. Чугунов В.А., Ермоленко З.М., Жиглецова С.К., Мартовецкая И.И., Миронова Р.И., Жиркова Н.А. и др. // Прикл. биохимия и микробиология. 2000. Т. 36. № 6. С. 666–671.
  20. Вешняков В.А., Хабаров Ю.Г., Камакина Н.Д. // Химия растительного сырья. 2008. № 4. С. 47–50.
  21. Чумаков М.И., Горбань В.В., Ковлер Л.Е., Соловова Г.К., Кривопалов Ю.В., Васильев А.Ю., Каменева С.В. // Микробиология. 1992. Т. 61. С. 92–102.
  22. Определитель бактерий Берджи / Ред. Дж. Хоулт, Н. Криг, П. Снит, Дж. Стейли, С. Уилльямса. М.: Мир, 1997. Т. 1. С. 421.
  23. Определитель бактерий Берджи / Ред. Дж. Хоулт, Н. Криг, П. Снит, Дж. Стейли, С. Уилльямс. М.: Мир, 1997. Т. 2. С. 799.
  24. Afzal I., IqrarI., Shinwari Z.K., Yasmin A. // Plant Growth Regul. 2017. V. 81. № 3. Р. 399–408.
  25. Иванчина Н.В., Гарипова С.Р., Хайруллин Р.М. // Агрохимия. 2018. № 4. С. 39–44.
  26. Чеботарь И.В., Лазарева А.В., Масалов Я.К., Михайлович В.М., Маянский Н.А. // Вестник РАМН. 2014. № 9–10. С. 39–50.
  27. Lin H.-R., Shu H.-Y., Lin G.-H. // Microbiol. Research. 2018. V. 216. P. 30–39. https://doi.org/10.1016/j.micres.2018.08.004
  28. He D., Wan W. // Frontiers in Microbiology. 2021. V. 12. Art 737116. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.737116
  29. Wan W., Qin Y., Wu H., Zuo W., He H., Tan J., Wang Y., He D. // Fronteirs in Microbiology. 2020. V. 11. Art. 752. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.00752
  30. Гарипова С.Р., Маркова О.В., Гарифуллина Д.В., Иванчина Н.В., Хайруллин Р.М. // Известия Уфимского научного центра РАН. 2018. № 3(1). С. 56–58.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2024