THE DIPOLARCALC SOFTWARE SYSTEM FOR ASSESSING THE POLARIZATION OF BIOLOGICAL MOLECULAR STRUCTURES

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The unique DipolarCalc software system is presented, which makes it possible to calculate the polarization of biomolecules through the total dipole moment of chemical bonds of “functional topological atoms” (FTA). The program implements a user-friendly interface that provides intuitive data entry and visualization of calculation results, as well as uses analytical expressions that allow accurate calculations to be performed in real time. The presented software package is aimed at use in computational biology and provides researchers with a convenient tool for modeling intramolecular and intermolecular interactions of biological molecular structures.

About the authors

I. K. Il’in

Lomonosov Moscow State University

Email: ilia.ilin.k@gmail.com
Moscow, Russia

Yu. A. Uss

Lomonosov Moscow State University

Email: ussyuri@gmail.com
Moscow, Russia

M. V. Shamolin

Lomonosov Moscow State University

Email: shamolin@rambler.ru
Moscow, Russia

L. A. Yan’ko

Lomonosov Moscow State University

Email: leanidyanko@yandex.ru
Moscow, Russia

References

  1. Pauling L. The Nature of the Chemical Bond and the Structure of Molecules and Crystals: An Introduction to Modern Structural Chemistry. Cornell University Press, 1960. 644 p.
  2. Ильин И.К., Янько Л.А., Усс Ю.А. Про граммная система DipolarCalc, 2025. https://github.com/ilia-ilin/DipolarCalc.git
  3. Никифоров А.И., Садовников Р.В. Примене ние методов параллельного программиро вания для моделирования потокоотклоня ющих технологий на компьютерах с ги бридной архитектурой // Программирова ние. 2019. № 1. С. 43–51.
  4. Аветисян А.И., Гайсарян С.С., Самоваров О.И. Возможности оптимального выполне ния параллельных программ, содержащих простые и итерированные циклы на неод нородных параллельных вычислительных системах с распределенной памятью // Программирование. 2002. № 1. С. 38–54.
  5. Морозов Д.Н., Трапезникова М.А., Четверуш кин Б.Н., Чурбанова Н.Г. Моделирование задач фильтрации на гибридных вычисли тельных системах // Матем. моделирование. 2012. Т. 24. № 10. С. 33–39.
  6. Allred A. L. (1961). Electronegativity values from thermochemical data // Journal of Inorganic and Nuclear Chemistry. 1961. V. 17(3-4). Р. 215–221.
  7. Норманская Ю.В., Борисенко О.Д., Белоборо дов И.Б., Аветисян А.И. Программная си стема LingvoDoc и возможности, которые она предлагает для документирования и ана лиза орбско-угорских языков // Доклады РАН. Математика, информатика, процессы управления. 2022. T. 504. № 1. С. 60–82.
  8. Xiaoming H. The application of queuing theory in harbour programming [J] // Journal of Qingdao university engineering & Technology edition. 1996. № 3.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences